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助力发文 | 胎儿生长受限的非靶向代谢组学研究

人阅读 发布时间:2023-07-24 10:48

 2023年5月23日,华银康集团高通量测序技术平台科研团队在技术支持、测序服务、数据分析等各方面协助广州市番禺区妇幼保健院科研团队在Metabolites期刊发表题目为“Non-Targeted Metabolomic Study of Fetal Growth Restriction”的研究论文,本文采用代谢组测序技术探究探索胎儿生长受限(FGR)胎儿羊水及其细胞中的差异代谢产物。

 

 

研究结果与结论

 

#1  孕妇和胎儿的临床特征

FGR胎儿的动态生长曲线结合综合临床特征表明,超声评估的胎儿体重或腹围低于相应胎龄的第10个百分位,生长受限的胎儿无法达到其遗传既定的生长潜力,而且FGR患者的母胎适应症发生率更高,在妊娠期间更有可能出现其他并发症(表1)。

表1  孕妇和胎儿的临床特征

#2  两组样品之间的代谢组学分析

在羊水上清液组中,FGR组(a组)和对照组(c组)的代谢分布有相当大的差异(图1b),FGR组和对照组之间有明显的分离趋势,位移试验的斜率大于零,表明该模型具有良好的稳定性。

图1  主成分分析。(a) QC样品质量控制图;(b) 羊水上清液组;(c) 羊水细胞沉淀组

图2  FGR与对照组的正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)和置换检验



#3  差异代谢产物的筛选及代谢途径分析
 

通过多维分析,选择VIP≥1,p≤0.05,FC>1.5,FC<0.667作为筛选标准。在羊水上清液样本中,鉴定了FGR组差异表达的27种代谢物(表2)(p<0.05)。同时,分析发现在羊水细胞沉积物样本中,FGR组有20种代谢产物(表2)差异表达(p<0.05)。最后,对已识别的差异进行了进一步的聚类分析,如图4所示,并将其显示在热图中。

图3  代谢物的分类

表2  FGR组和对照组之间的差异代谢产物

图4  差异代谢产物聚类分析热图


#4  相关代谢途径分析

通过KEGG数据库分析了代谢网络,结果表明FGR组受多种代谢途径的影响,包括三羧酸循环(TCA循环)、ABC运输系统、癌症中心碳代谢、氨酰tRNA生物合成、蛋白质消化和吸收、矿物质吸收、乙*醛酸和二羧酸代谢,以及丙氨酸和谷氨酸代谢。

图5  不同代谢产物KEGG通路分析的气泡图

 

 

 

总 结

综上所述,通过对胎儿生长受限羊水代谢产物的批量定性和定量分析,作者发现了许多与FGR相关的代谢变化,主要表现为羊水中氨基酸代谢异常和羊水细胞中葡萄糖代谢异常,包括TCA循环。
以上的发现为探索FGR的机制和潜在的治疗靶点提供了更多的数据。

研究胎儿生长受限的研究方向可以使用多种技术和方法,除了使用代谢组测序方法胎儿相关体液中代谢产物的组成和变化,还可以使用表观组学、单细胞组学的方法,协助老师您更为深入地研究胎儿生长受限相关在表观遗传上、在基因表达和细胞功能上的变化,这些研究有助于加深我们对胎儿生长受限机制的理解,并为未来开发相关的诊断和治疗方法提供线索。以下是高通量测序检测中心为您提供的夏日促销活动,欢迎各位老师随时询价~

 

参考文献

Chen F, Li Z, Xu Y, Huang S, Li Y, Jiang W. Non-Targeted Metabolomic Study of Fetal Growth Restriction. Metabolites. 2023; 13(6):761. https://doi.org/10.3390/metabo13060761


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